A junção do Ministério da Educação com o da Ciência e Ensino Superior acrescenta um secretário de Estado aos três existentes nos anteriores governos e muda os nomes das respectivas pastas.
O novo ministro, Nuno Crato, passa a ter um secretário de Estado do Ensino e da Administração Escolar, João Casanova de Almeida (CDS-PP), e uma secretária de Estado do Ensino Básico e Secundário, Isabel Maria Santos Silva.
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João Casanova de Almeida foi chefe de gabinete do grupo parlamentar do CDS-PP e é licenciado Ciências da Educação, Administração e Gestão Escolar.
Isabel Maria Santos Silva é professora auxiliar no departamento de Psicologia da Universidade de Évora, sendo doutorada em Psicologia, pela mesma universidade, sobre os processos cognitivos e conhecimentos envolvidos nas etapas iniciais da aprendizagem da leitura.
Desde 2009, a nova secretária de Estado do Ensino Básico e Secundário integra o grupo de trabalho responsável pelo estudo psicolinguístico para «Estabelecimento de níveis de referência na aprendizagem da leitura e da escrita do 1.º ao 6.º ano de escolaridade», realizado no âmbito do programa de acompanhamento e de monitorização do Plano Nacional de Leitura.
O novo secretário de Estado do Ensino Superior é o professor catedrático do Departamento de Matemática da Universidade de Coimbra João Filipe Rodrigues Queiró, enquanto que a Ciência fica a cargo da professora universitária Maria Leonor Parreira, da Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa.
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João Filipe Rodrigues Queiró já foi presidente da Comissão Científica do Departamento de Matemática da FCTUC e membro do Board da International Linear Algebra Society. Foi também presidente do Centro de Matemática da Universidade de Coimbra e vice-presidente do Centro Internacional de Matemática.
Além de professora universitária, Maria Leonor Parreira trabalha no Instituto de Medicina Molecular e é investigadora do Instituto Gulbenkian Ciência.
No anterior Governo, existiam igualmente duas secretarias de Estado no Ministério da Educação, mas com pastas diferentes das atuais - da Educação e outra de Adjunto e da Educação.
Quanto ao anterior Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior, tinha apenas uma secretaria de Estado do Ensino Superior.
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